Подводная лодка тип «Щ» Х серии заложена 4 декабря 1934 года на заводе №-189 (Балтийский завод) в Ленинграде как «Щ-313». 28 июня 1935 года спущена на воду, 17 июля 1936 года вступила в строй, вошла в состав Краснознаменного Балтийского флота. 16 мая 1937 годапереименована в Щ-401
Летом 1938 года по Беломоро-Балтийскому каналу подводная лодка перешла на Север и 27 июня 1937 года вошла в состав Северного флота.
В ходе Советско-финской войны Щ-401 находилась в ремонте. К началу Великой Отечественной войны подводная лодка находилась в составе 3-го дивизиона Бригады подводных лодок Северного флота, совершила семь Боевых походов, потопила одно судно.
В последний Боевой поход с задачей прикрытия конвоя QP-10 в районе острова Фуглё Щ-401 вышла в ночь на 11 апреля 1942 года. 18 апреля по приказу командования перешла к мысу Нордкап. Днем 19 апреля у мыса Омганг безуспешной атаке подводной лодки подвергся танкер «Forbax». Сопровождавшие конвой тральщики M154 и M251 провели противолодочный поиск и сбросили в предполагаемом месте нахождения подводной лодки тринадцать глубинных бомб. Сопровождавшие конвой немецкие охотники Uj1101 и Uj1110 контратаковали подводную лодку, сбросив пятьдесят глубинных бомб. Глубинные бомбы охотников не нанесли подводной лодке каких-либо серьезных повреждений, так как вечером 23 апреля Щ-401 вышла на связь с докладом о двух атаках с использованием всех торпед в носовых торпедных аппаратах. Это было последнее донесение с борта Щ-401. На дальнейшие вызовы с приказом о возвращении подводная лодка не отвечала.
Возможные причины гибели: подрыв на мине заграждения «Karin» (штаб Северного флота на тот момент еще не знал о постановке мин в этом районе и, следовательно, не предупредил командира подводной лодки о соблюдении каких-либо мер предосторожности), подрыв на плавующей мине, а также ошибка личною состава или отказ техники.
В октябре 1944 года подводная лодка исключена из состава ВМФ СССР.
На начало 2019 года считается пропавшей без вести, точное время гибели и место не установлены.
Вечная слава погибшим героям.
После 23 апреля 1942 г. Великая Отечественная война. Северный флот. Возможно на минном заграждении «Карин» подорвалась средняя подводная лодка Щ-401 «Барс» в районе о. Фулей позиция 106. Возможна гибель в результате атаки своих торпедных катеров ТКА-13, ТКА-14 в районе острова Варде. Погибли:
- капитан-лейтенант Моисеев Аркадий Ефимович – командир ПЛ, 1913 года
- старший политрук Вересовой Василий Николаевич – военком ПЛ, 1914 года
- старший лейтенант Паушкин Николай Александрович – командир БЧ-1, 1918 года
- лейтенант Чаплин Георгий Матвеевич – командир БЧ-2,3, 1915 года
- инженер капитан-лейтенант Семенов Петр Васильевич – командир БЧ-5, 1907 года
- старший военфельдшер Бабенко Петр Алексеевич – фельдшер, 1916 года
- лейтенант Нагин Дий Георгиевич – дублер командира БЧ-2,3, 1919 года
- старший лейтенант Ковалев Борис Григорьевич – дивизионный штурман, 1913 года
- краснофлотец Александров Михаил Александрович – рулевой, 1920 года
- старший краснофлотец Антоненко Николай Васильевич – старший торпедист, 1921 года
- старший краснофлотец Багров Иван Павлович – старший моторист, 1919 года
- краснофлотец Бала Алексей Григорьевич – старший моторист, 1919 года
- краснофлотец Баранов Николай Григорьевич – рулевой, 1919 года
- старшина 2 статьи Большаков Василий Степанович – командир отделения трюмных, 1916 года
- старший краснофлотец Горностаев Виктор Гавриилович – кок, 1914 года
- краснофлотец Гребеньков Дмитрий Федорович – электрик, 1920 года
- краснофлотец Гриценко Андрей Андреевич – электрик, 1918 года
- главный старшина Девяшов Николай Михайлович – старшина группы торпедистов, 1915 года
- краснофлотец Дементьев Федор Григорьевич – старший моторист, 1921 года
- краснофлотец Клепиков Александр Иванович – строевой, 1920 года
- краснофлотец Лазарев Николай Александрович – радист, 1914 года
- старшина 2 статьи Любов Герман Александрович – командир отделения торпедистов, 1916 года
- старшина 2 статьи Масолов Евгений Матвеевич – командир отделения электриков, 1918 года
- старшина 1 статьи Масюков Сергей Яковлевич старшина группы СКС дивизиона, 1917 года
- старший краснофлотец Морозов Виктор Семенович – старший моторист, 1915 года
- краснофлотец Немченко Иван Ильич – торпедист, 1920 года
- краснофлотец Пименов Алексей Петрович – трюмный, 1917 года
- старшина 2 статьи Поликарпов Константин Михайлович – командир отделения акустиков, 1921 года
- главный старшина Протасов Николай Иванович – старшина группы рулевых, 1911 года
- старший краснофлотец Пуфкоев Александр Васильевич – старший рулевой, 1915 года
- краснофлотец Рябков Иван Александрович – акустик, 1913 года
- старшина 1 статьи Самбуров Иван Алексеевич – командир отделения рулевых, 1915 года
- главный старшина Сафонов Александр Александрович – старшина группы трюмных, 1915 года
- главный старшина Стрелков Григорий Васильевич – старшина группы мотористов, 1905 года
- старшина 2 статьи Стрижаченко Дмитрий Дмитриевич – командир отделения штурманских электриков, 1917 года
- краснофлотец Тремтий Николай Степанович – трюмный, 1921 года
- краснофлотец Третьяк Николай Яковлевич – рулевой, 1920 года
- старшина 2 статьи Харьков Василий Филиппович – командир отделения мотористов, 1916 года
- главный старшина Хлыстов Виктор Иванович – старшина группы радистов, 1915 года
- старшина 1 статьи Царев Марк Иванович – старшина группы электриков, 1916 года
- краснофлотец Черкасов Дмитрий Алексеевич – командир отделения комендоров, 1918 года
- краснофлотец Шендорович Иосиф Яковлевич – штурманский электрик, 1916 года
- старший краснофлотец Шутов Александр Александрович — старший электрик, 1917 года